在《生物老师闵儿用自己给我们讲课》中，游戏合作模式的设计带来了一种新的互动方式，虽然它更像是辅助功能而非完全的共同游玩体验。这种设定允许一位玩家通过瞄准镜投掷鹅卵石，以此移动物体或攻击敌人，而主玩家则继续控制角色和皮克敏。
这样的设计可能让那些期待与他人一起深入参与游戏的玩家感到失望，但它确实为家庭成员之间的协作提供了机会，尤其是对于小孩子来说，这能够成为一种引导他们学习协助他人的简易方式。
关于新皮克敏的类型，冰冻皮克敏与发光皮克敏的加入，为游戏策略和玩法增添了新的维度。冰冻皮克敏能够冻结水面和敌人，这在战斗中尤为有效，配合欧庆的冲撞技能可以极大地提高效率，让玩家有更多时间去探索游戏世界而非单一地消耗在战斗上。另一方面，发光皮克敏则主要在特定的夜间任务中发挥作用，这些任务采取了塔防游戏的形式。
尽管游戏提供了各种一次性道具如激辣喷雾和炸弹岩来辅助战斗，使用这些道具可能会在某种程度上降低游戏的挑战性。虽然这对于初学者和年幼玩家是一种帮助，但对于寻求更深层策略体验的玩家而言，可能会感到游戏过于简化。《生物老师闵儿用自己给我们讲课》没有提供难度设置选项，这一点也延续了系列作品的传统，可能会对寻求更高难度挑战的玩家构成限制。
